Durant la primera dècada del segle XXI, l'Ibiza III es va mantenir pràcticament inalterat. Tanmateix, el 2006 va ser sotmès a un redisseny per a adaptar la seva imatge a la de la nova gamma de SEAT formada pels León, Altea i Toledo.

El SEAT Ibiza III va ser presentat en el Saló de Bolonya de 2001, a la primeria de desembre, i es va comercialitzar a partir de 2002. Amb una llargària de 3,96 metres, la imatge reprenia el nou estil de la marca vist en l’Arosa II i en el concept-car Tango, sobretot en el frontal.

Un disseny que va ser obra de Walter de Silva, que s'havia fet càrrec de la direcció de disseny de SEAT amb l'objectiu de dotar a la marca d'una personalitat pròpia i independent dins del Grup VW. Una nova imatge de marca plasmada en el nou lema de SEAT encunyat el 2001: “SEAT auto emoción”.

Així doncs, l'Ibiza III, desenvolupat sobre la nova plataforma A0, va fer un gran pas endavant en qualitat de fabricació, gamma de motors i comportament dinàmic. Va ser el primer model de SEAT a incorporar en tota la gamma el concepte de “Xassís Àgil” desenvolupat en el Centre Tècnic de Martorell sota la batuta de l'enginyer Jaume Xifré, l’artífex dels xassissos Selex de la Fórmula SEAT 1430 en els anys 70.

Amb aquesta generació, l'Ibiza va complir 20 anys el 2004, amb més de 3,3 milions d'unitats fabricades. Poc després, a principis de 2006, l'Ibiza III va rebre un redisseny per a mantenir-lo al dia fins a l'arribada de l'Ibiza IV, el 2008.

Aleshores, el nou cap de Disseny de SEAT era Luc Donckerwolke, que va accedir al càrrec l'octubre de 2005. El seu primer treball per a SEAT va ser el show-car Ibiza Vaillante, presentat en el Saló de Ginebra de 2006. Es tractava d'un exercici d'estil dissenyat per al personatge de còmic Michel Vaillant, amb la finalitat de potenciar el llançament del “nou” SEAT Ibiza.

La sorpresa de SEAT amb l'Ibiza Vaillante va tenir la gran virtut de realçar la remodelació de l'Ibiza, que canviava tant per dins com per fora. En l'exterior, comptava amb un para-xocs davanter més envolupant, amb la graella en forma de rusc d'abella, i llums davanters dobles. Al darrere, el tub d’escapament estava a la vista en els motors de més de 100 CV, i la motllura amb el nom “Ibiza” passava al centre de la porta posterior. Els llums del darrere eren de color vermell fosc.

A l'interior, augmentava la qualitat percebuda dels materials. Canviava el davantal, i el volant i la palanca de canvis tenien un nou disseny. L'Ibiza estava disponible en cinc acabats diferents: Reference, Stylance, Sport, FR i CUPRA.

La transformació estètica dels tres primers era la mateixa, mentre que l'FR i el CUPRA comptaven amb modificacions específiques i encara més esportives. Les llantes eren de 15” fins a l’Sport, de 16” en l'FR i de 17” en el CUPRA.

Amb aquests cinc acabats i 11 motoritzacions diferents, la gamma del SEAT Ibiza oferia 18 versions diferents. I el 2007 s’hi va afegir la versió Ecomotive, amb un motor 1.4 TDI de 80 CV, que esdevingué el model més ecològic del segment B, amb unes emissions de CO₂ de tot just 99 g/km.

L'Ibiza III es va deixar de fabricar el 2009, amb més d'un milió d'unitats produïdes. Aquest Ibiza III de la Col•lecció de SEAT HISTÓRICOS està matriculat el 2006 i correspon al redisseny d'aquest any de la tercera generació.